由幾個小島連成一體的“獨腳樂園”，由於污染比較嚴重，變得烏煙瘴氣，環境惡劣。
獨腳城的統治者壟斷軍火商“哼哼”與大礦山主“哈哈”陰柔惡損，表面紳士有禮，實際卻狡猾貪婪，無惡不作，信奉金錢至上，兇狠殘暴。他們倆掌握著居民生殺大權和城市的經濟命脈，通過強權統治著整個城市，並最大限度地壓榨窮人，以取得他們的財富。手下的員警頭目鐵腕總監，管理一支龐大、無孔不入的員警和密探隊伍，對哼哼和哈哈忠心耿耿，說一不二。負責管理都市的是面子市長。他曲迎奉和、八面玲瓏、外表風光。但窮人們都對他很不滿，高官們他又一個都拉攏不了。鐵腕總監又老在背後搞小動作，而其他人根本就說不上話，屬於一個兩頭都不討好的受氣人物。
一輩子在炮彈工廠辛勤勞作的“桔子爺爺”，終於用收集來的廢料製造出真正屬於自己的得意作品——兩個模樣相同的醜娃娃。老爺爺用錘子“叮叮咚咚”敲打一番，結果兩兄弟因此而得“叮叮”和“咚咚”。哥哥“叮叮”為人聰慧，精明能幹；弟弟“咚咚”幽默頑皮，勇敢正義。
“哼哼”和“哈哈”認為獨腳城不能私自製造孿生兄弟，因此對叮叮咚咚發出通緝令，全城頓時陷入恐慌，員警和密探傾巢出動，追捕“叮咚”兄弟。奔逃中，兄弟兩人哥哥“叮叮”被抓，弟弟“咚咚”則掉到了下水道裏，從此兄弟兩人的命運反生了天翻地覆的轉變。
咚咚在下水道裏遇到了受哼哼哈哈的迫害而隱居起來的學者，看到了他培育出來的不死草，深受啟發，並和學者約定將來共建綠色、平等的獨腳城。回到貧民區後咚咚結識了許多患難與共的好夥伴，並因此認清了哼哼哈哈的醜惡面貌。他不甘心受到壓榨，帶領著小夥伴們和強權勢力進行抗爭，並把統治階層最後的威懾力：耗費稅款、鉅資豢養——寵物魔怪貓拆的七零八落。
而叮叮則甘心投靠了財大氣粗的統治者哼哼哈哈，認作“哼哼”與“哈哈”的乾兒子，嬌生慣養，培養了很多不好的習慣，變得唯我獨尊，不可一世。並且也想方設法地幫著哼哼哈哈欺侮窮人，有些地方更是有過之而無不及。而咚咚念著兄弟的情分，始終想通過感化，把叮叮的觀念扭轉過來，故事因此展開…… |
